1) Felt som utnytter protein sekvenser, uttrykk og strukturen for å fastslå relasjonene proteiner, samhandle og fungere i en organisme; inkluderer karakterisere og katalogisering proteiner og protein biblioteker, sammenligne variasjoner i protein uttrykk nivåer under ulike forhold, studere protein interaksjoner og funksjonsroller; teknikker er utført i en automatisert, store måte; kan også innebære bioinformatic analyse og lagring av data.

2) Systematisk undersøkelse av den komplette komplettere proteiner (proteom) av organismer.

3) En gren av bioteknologi opptatt å bruke teknikker for molekylærbiologi, biokjemi og genetikk analyserer strukturen, funksjon og interaksjoner av proteiner produsert av genene for en bestemt celle, vev eller organisme, med organisere informasjon i databaser, og med programmer dataene (som medisin eller biologi).

4) Studiet av gener og deres resulterende proteiner rollen spilt av proteiner i kroppen biokjemiske prosesser.