I 1990 kom den første indikasjonen for eksistensen av nucleic acid sekvens guidet gene silencing fra forskere som var introduserer flere kopier av en ansvarlig for darkening av blomst farge i genom Petunia gene. i tillegg til å opprette mørkere blomster, innsetting av flere kopier av gene opprettet hvite blomster eller blomster med oppdateringer av hvitt blandet med oppdateringer av farge (variegated). Hvit og variegated planter hadde anerkjent den nylig innførte transgenes som utenlandske og merket dem, så vel som endogen homologous gene for silencing – en prosess som ble kjent som cosuppression.

Påfølgende eksperimenter viste at ribonucleic acid (RNA) transkribert fra transgenes var silencing utløseren. Andrew brann og kolleger som er oppdaget i 1998 som injeksjon av RNA-dobbel-stranded (dsRNA) i nematode-ormen Caenorhabditis elegans forårsaket sekvens-spesifikke nedbrytning av cytoplasmic messenger RNAs (mRNAs) som inneholder den samme tastesekvensen som dsRNA utløser. Dette fenomenet ble kalt RNA-interferens (Molecular), og snart var knyttet til cosuppression-hendelser som er beskrevet tidligere i planter.