Begrenser bevegelsen av (genmodifiserte) organismer ved å arrangere barrierer for å hindre dem fra å vokse utenfor laboratoriet. Biologiske containment kan ta to former: gjør organismen klarer å overleve i det ytre miljøet, eller gjør det ytre miljøet ugjestmilde på organismen. Sistnevnte er sjelden egnet for bakterier, som, i prinsippet kunne overleve nesten hvor som helst. Dermed for bakterier og gjær, den favoriserte tilnærming er å mutere genene i organismen, slik at de krever en tilførsel av en bestemt næringsstoff som er vanligvis bare tilgjengelig i laboratoriet. Hvis de komme ut, de deretter kan ikke vokse. Gjør miljøet uvennlig for organismen er delvis en biologisk kontroll, delvis en fysisk en. Dermed, noen av den første episoden av ris stammer ble utviklet i England (som er for kaldt for ris å vokse) og prøvde i feltet i Arizona (der det er for tørr). Biologiske containment kan også innebære bruk av vektor molekyler og vert organismer som har deaktivert genetisk slik at de kan overleve bare i de særegne vilkårene som følger av eksperimentator og som er utilgjengelige utenfor laboratoriet.