Kryptering er metoden for å transformere lesbare data til uleselig data i forbindelse med hemmelighold. Når kryptert, slike data kan ikke tolkes (enten hos mennesker eller maskiner) før det er dekryptert. Kryptering utføres ved hjelp av en krypteringsalgoritme og en hemmelig verdi som kalles en 'nøkkel'. Kryptert data kan ikke generelt dekrypteres uten kunnskap om hemmelig 'nøkkel' eller betydelige ressurser. Malware kan bruker kryptering for å obfuscate sine koden (at koden ikke kan leses), håper dermed å hindre sin oppdagelse og fjerning fra den berørte datamaskinen. A felles og enkel kryptering teknikk brukt av malware er XORing, som utelukkende Or (XOR) beregningsorientert operasjonen brukes til hver bit i henhold til en angitt nøkkel. Malware kan bruke cryptors til å kryptere koden sin.