En form for VNTR (eksemplarer). Spesielt et segment av DNA preget av forekomsten av et variabelt antall kopier (fra noen få til 30 eller så) av en rekke rundt 5 eller færre baser (kalt en gjenta enhet, eksemplarer). A typisk mikrosatellittmarkør er gjenta enheten AC, som oppstår på ca 100 000 forskjellige steder i en typisk pattedyr genom. På ett område (locus), er det vanligvis flere forskjellige "alleler," hver identifiserbar i henhold til antallet gjenta enheter. Disse alleler kan oppdages av PCR (eksemplarer), bruke grunning designet fra unike sekvensen som ligger på hver side av mikrosatellittmarkør. Når den PCR produktet kjøres på en electrophoretic gel, alleler er sett til ulik lengde i enheter lik størrelsen på Gjenta enheten, f.eks hvis primerne tilsvarer unike sekvensen umiddelbart på hver side av mikrosatellittmarkør hver 20 baser lang og er en person er heterozygote for AC mikrosatellittmarkør med en allelet består av 5 gjentar og den andre består av 6 gjentar, heterozygot har to band på gel, ett band som 20 + (2 × 5) 20 = 50 baser lang, og det andre allelet 20 + (2 × 6) 20 = 52 baser lang. Microsatellites har vært standard DNA markør: de er lett detectable av PCR, og de har tendens til være jevnt plassert i genomet. Tusenvis har blitt kartlagt i mange forskjellige arter.