En analysen for å oppdage i vivo protein-protein interaksjoner, som avhenger av uttrykk for en reporter genet, vanligvis i gjær. Som transkripsjon av eukaryote enzymer er regulert av transcriptional aktivator å ha forskjellige DNA-bindende og transcriptional aktivator domener, koding sekvenser for hver av disse domenene kan være smeltet sammen med koding sekvenser for hver av de to proteinene skal testes; hvis proteiner binde, DNA-bindende og transcriptional aktivatoren domener vil bli gjenforent, tillater transkripsjon av reporteren genet. Vanligvis systemet brukes til å oppdage en bindende partner av en kjent protein (kodet i agn vektoren som en chimera med DNA bindende domene av transkripsjon factor) til en kandidat partner (kodet i byttedyr vektoren som en chimera med aktivisering domenet av transkripsjon factor), som er homologue av en kjent bindende partner eller er kodet av en cDNA-biblioteket.