Transformasjon, via fotosyntese i havet overflatelaget av anlegget celler (primært planteplankton), oppløste uorganiske karbon (DIC) i biogene karbon, inkludert, for eksempel CaCO ³ i skjell av coccolithophorids. Fotosynteseaktiviteten organismer omfatter uorganiske karbon tilbake mye av det til CO ² i overflatelag via åndedrett, men en betydelig andel bosetter seg under den viktigste termoklinen. Dette er en oseanisk vasken for atmosfærisk CO ² der et regn av små rusk som består av planteplankton skjell og dyreplankton fecal pellets og molts vask ut av overflaten havvannet. Disse synker partikler Fjern POC fra overflaten blandet lag i lagdelt, relativt dyp lag der, på en millenial tidsskala, det er ikke lenger mottakelig for å utveksle med atmosfæren. Partikler saken fjernet på denne måten kalles eksport flux.

Det er anslått at 75% av forskjellen i DIC konsentrasjon mellom overflate og dype havene skyldes biologiske pumpen. Hvis denne pumpen ble eliminert, karbon løslatt fra dyphavet som det equilibrated med atmosfæren vil mer enn dobbelt co 2-konsentrasjonen i atmosfæren. På en global skala, nedadgående transport av CO ² av fysiske (dvs. vertikal transport av CO ²-laden vann) og biologiske pumper utgjør rundt 102 Gt C yr ^-1. Oppover fysisk transport er ca 100 Gt C yr ^-1, forlater en netto opptak av ca 2 Gt C yr ^-1.